O Movimento Humanista conta com uma estrutura humana organizada em grupos que se designam por conselhos. Estes conselhos realizam uma reunião semanal, aberta à participação de todos os membros, onde se planifica a actividade e se fazem práticas de trabalho pessoal. Estas práticas consistem basicamente na reflexão e intercâmbio sobre temas da vida pessoal e social. A actividade consiste na dinamização de frentes de acção política, social e cultural.

Cada grupo é composto por regeneradores ou estruturais, que formam grupos e dinamizam frentes; administrativos, encarregados de que toda a informação circule e chegue a cada participante; e apoios, que ajudam ao fortalecimento e crescimento pessoal dos membros.

Na estrutura do Movimento Humanista, cada um orienta o que constrói, não relevando para este efeito questões de antiguidade, idade, habilitações académicas, parentesco, patentes ou outras.

Os compromissos que assumem os membros de estrutura são dois: participar das reuniões semanais e contribuir semestralmente com uma quota para a manutenção das actividades globais da estrutura.